Le Comité de Pilotage est responsable de l'orientation, du suivi et de l'évaluation de la mission et des objectifs du Centre. Il est composé de représentants des Instituts Scientifiques Fédéraux, des universités et des centres de recherche, du secteur privé, d'un membre international et des départements fédéraux (SPF Santé et SPF Économie). En outre, 5 membres du Comité sont nommés au Bureau, qui se réunit au moins une fois par mois pour fournir des conseils et superviser la gouvernance du Centre.

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Les membres du Comité de Pilotage du Centre Belge du Climat sont :

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• Arnaud Vajda, Politique Scientifique Fédérale (BELSPO)

• Daniel Gellens, Institut Royal Météorologique (IRM/KMI)

• Martine De Mazière, Institut royal d'Aéronomie Spatiale de Belgique (IASB/BIRA)

• Hans Beeckman, Musée royal de l’Afrique centrale (MRAC/KMMA)

• Sophie Verheyden, Institut royal des Sciences naturelles de Belgique (IRSNB/KBIN)

• Charline Urbain, ULB

• Michel Moutschen, ULiège

• Nicole van Lipzig, KULeuven

• Michel de Paepe, UGent

• Filip Lefebre, VITO

• Aurore de Boom, Greenwin

• Nancy Mahieu, SPF Économie - DG Énergie

• Peter Wittoeck, SPF Santé - DG Environnement

• Luc Bas, CERAC

• Hein Lannoy, Assuralia

• Inge Arents, Flanders Food